O Mattos Filho presta atendimento jurídico gratuito para organizações de direitos humanos e pessoas físicas em situação de vulnerabilidade social e econômica, com foco nos direitos das mulheres, da população LGBTQIAPN+, das crianças e adolescentes, dos refugiados e migrantes e nas áreas de justiça criminal e direitos étnico-raciais. Também apoia ações de litígio estratégico e advocacy e oferece pesquisa para casos de referência, que tenham repercussões tanto no Brasil quanto perante órgãos internacionais. Para fortalecer a sociedade civil, oferece assessoria para organizações e coletivos em estágio inicial de formalização em aspectos societários, tributários, trabalhistas, regulatórios e de propriedade intelectual.

Em 2024, para celebrar os 25 anos da atuação pro bono, o escritório lançou o terceiro volume da publicação "Direitos humanos em evidência: pesquisas e estudos elaborados pelo Mattos Filho em sua atuação pro bono", que traz estudos e pesquisas produzidos em parceria com organizações atuantes em defesa dos direitos humanos. Ainda como parte das comemorações, teve início em 2025 uma iniciativa inédita no país: a parceria entre a prática 100% Pro Bono com a FGV Direito SP para atuação na Clínica de Litigância Estratégica em Direitos Humanos, combinando pesquisa acadêmica, ensino e advocacia pro bono para desenvolver casos de alto impacto em direitos humanos nas cortes nacionais.